1、意思不同
汽车总站是指组织公路客、货运输业务的基层单位。有汽车运输企业组建和地方交通部门组建的两种。
客运站是指专门办理客运业务的车站。一般设在政治、经济，文化中心等有大量旅客到发的城市，其主要用途是组织旅客安全乘降和迅速集散。
2、作用不同
客运总站主要有站房，站前广场和站场三部分组成，它们各有不同的作用，但在布局上是一个不可分割的整体就是某城市对周边城市的客车运输干线集中营。
汽车客运站是专门办理旅客运输业务的汽车站，一般设在公路旅客集散点，其规模大小视当地的客运量而定。中国把汽车客运站分为三等。省辖市及港口、铁路枢纽一般设一等站；县、市人民政府驻地一般设二等站；乡政府驻地或较大集镇设三等站。客运站的主要工作分商务和车务两大部分。
玉林客运站和玉林汽车总站的区别 扩展
玉林客运站是民营的客运站，其班次大部份是晚上发往广西区外的长途客车，主要是发往广东深圳珠三角一带的长途客运大巴，白天有小部份班次，大部份客运车都是旅客上车后车主才卖票给旅客，票价可以压价，等满客了才走，发车不准时。玉林汽车总站是正规的市汽车总站，其主要是负责广西区内各市县及玉林市各乡镇的综合客运车辆的进、出站管理，也有小部分来往区外的班次，玉林汽车总站有固定的售票窗，先购票后上车，按客运时间准时发车。
